Genetic diversity between native cupuÃzeiros from Portal da Amazonia, Mato Grosso, Brazil
DOI:
https://doi.org/10.36560/1332020833Palavras-chave:
ISSR, Theobroma subincanum, Genetic variability.Resumo
Theobroma subincanum Mart. popularly known as cupuÃ, belongs to the family Malvaceae. It is a wild fruit species native to the Amazon and is found in mainland forests, being characterized by its great alimentary and ecological importance. The cupuà presents genes that can be used for the croop breeding of commercial species of the genus, so that many studies have been carried to characterize genotypes through molecular markers, among which ISSRs (Inter Simple Sequence Repeats) have been widely used. In this context the objective of the study was to analyze the genetic diversity among cupuà genotypes, using molecular markers ISSR. Ten markers used amplified 42 fragments, being 35.71% polymorphic, and the genetic dissimilarity, estimated from the Jaccard coefficient, varied from 0.02 to 0.26, indicating the existence of genetic variability among the studied genotypes. The UPGMA grouping method allocated the twenty genotypes of cupuà analyzed in three groups, while the Tocher optimization method distributed the same in eight groups, thus confirming the existence of genetic diversity among the evaluated materials. The two methods of grouping revealed that the MN08, MN09 and MN10 individuals are the most divergent and therefore the most suitable for conservation and breeding programs of the species.
Referências
ALVES, R.M., SILVA, C.R.S., SILVA, M.S.C. SILVA, D.C.S., SEBBENN, A.M. Diversidade genética em coleções amazônicas de germoplasma de cupuaçuzeiro [Theobroma grandiflorum (Willd. ex Spreng.) Schum]. Revista Brasileira de Fruticultura, 35 (3): 818-828, 2013.
ARENAS-DE-SOUZA, M.D., ROSSI, A.A.B., VARELLA, T.L., DA SILVEIRA, G.F., SOUZA, S.A.M. Stigmatic receptivity and pollen viability of Theobroma subincanum Mart.: Fruit species from the amazon region. Revista Brasileira de Fruticultura, 38 (4): 757, 2015.
ARRIEL, N.H.C. et al. Técnicas multivariadas na determinação da diversidade genética em gergelim usando marcadores RAPD. Pesquisa Agropecuária Brasileira, 41 (5): 801-809, 2006.
BORÉM, A., CAIXETA, E.T. Marcadores Moleculares. 3. ed. Viçosa: UFV. 385p. 2016.
CHARTERS, Y.M., WILKINSON, M.J. The use of self-pollinated progenies as ‘in-groups’ for the genetic characterization of cocoa germplasm. Theoretical and Applied Genetics, 100 (1): 160-166, 2000.
CRUZ, C.D. GENES - a software package for analysis in experimental statistics and quantitative genetics. Acta Scientiarum, 35 (3): 271-276, 2013.
DE OLIVEIRA, H.O. et al. Otimização das temperaturas de anelamento de marcadores microssatélites Theobroma grandiflorum para caracterização de resistência à Moniliophthora perniciosa. In: XXIII CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA.2014, Cuiabá. Anais eletrônicos... Cuiabá: Sociedade Brasileira de Fruticultura. 2014. https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/108548/1/TRA3599.pdf
DO NASCIMENTO, W.M.O., DE CARVALHO, J.E.U. Sensibilidade de sementes de Cupuà (Theobroma subincanum) à redução do grau de umidade e a exposição à baixa temperatura. Revista Brasileira de Fruticultura 34 (3): 915-920, 2012.
DOYLE, J.J., DOYLE, J.L. A rapid DNA isolation procedure for small amounts of fresh leaf tissue. Phytochemical Bulletin, 19 (1): 11-15, 1987.
FALEIRO, F.G. et al. Otimização de extração e amplificação de DNA de Theobroma cacao L. visando obtenção de marcadores RAPD. Agrotrópica, 14 (2): 31-34, 2002.
FLORA DO BRASIL. Flora do Brasil 2020 em construção. Theobroma, Jardim Botânico do Rio de Janeiro. 2018. http://floradobrasil.jbrj.gov.br/reflora/floradobrasil/FB23623
GIUSTINA, L.D. et al. Population structure and genetic diversity in natural populations of Theobroma speciosum Willd. Ex. Spreng (Malvaceae). Genetics and Molecular Research, 13 (2): 3510-3519, 2014.
LIMA, E.N., DE ARAUJO, M.E.B., BERTINI, C.H.C.M., MOURA, C.F.H., HAWERROTH, M.C. Diversidade genética de clones de aceroleira avaliada por meio de marcadores moleculares ISSR. Comunicata Scientiae, 6 (2): 174-180, 2015.
MARIOT, A., MANTOVANI, A., BITTENCOURT, R., DOS REIS, M.S. Aspectos da biologia reprodutiva de Drimys brasiliensis Miers (Winteraceae) em Floresta Ombrófila Mista, Sul do Brasil. Ciência Florestal, 24 (4): 877-888, 2014.
OLIVEIRA, T.C., GONÇALVES, D.L., ELIAS, J.C.F., CASTRO, M.S., BARELLI, A.A.A. Caracterização morfológica de acessos de cagaiteira na região de Cáceres - MT, Agrarian Academy, 1 (2): 26-36, 2014.
RAMALHO, A.B. et al. Diversidade genética entre genótipos de Bertholletia excelsa por meio de marcadores moleculares ISSR. Floresta, 46 (2): 207-214, 2016.
RIVAS, L.H. et al. Genetic diversity in natural populations of Theobroma subincanum Mart. in the Brazilian Amazon. Genetics and Molecular Research, 12 (4): 4998-5006, 2013.
ROCHA, V.D. et al. Genetic diversity among Hymenaea courbaril L. genotypes naturally occurring in the north of Mato Grosso State, Brazil, Genetics and Molecular Research, 16 (3): gmr16039706, 2017.
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