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Reviews
Published: 2022-10-01

Main methods of DNA sequencing

Universidade de Cuiabá
Universidade de Cuiabá
Universidade de Cuiabá
Sequencing, DNA, Biotechnology, Genome

Abstract

Deoxyribonucleic acid (DNA) sequencing is the result of a series of biochemical procedures whose main purpose is to determine the sequence of nitrogenous bases, which are: adenine (A), guanine (G), cytosine (C) and thymine (T). DNA sequencing is extremely important because it is used in the identification, diagnosis and treatment of diseases and mainly in biotechnological production to develop new products and services. Currently, DNA sequencers are divided into 1st generation (Maxam-Gilbert and Sanger Method) which consists of radioactively labeling some free deoxynucleotides and adding them to a DNA template strand and later reading in PCR printing. In the 2nd generation (454-Roche, Illumina Genome and SOLID) it is a technique whose principle is the detection of a pyrophosphate released during the incorporation of the deoxynucleotide to the DNA template strand. In the 3rd generation (Ion Torrent) it works by releasing hydrogen ions whenever a nucleotide is attached to a DNA template strand, generating a chemical signature. In the 4th generation (Nanopore) the technique aims to identify the DNA that passes through a nanopore, where each nucleotide that passes through is registered a different electrical signal generating a molecular signature. With this it is possible to identify that over time and with the development of technology this process was being modified and improved seeking better quality and shorter sequencing time

References

  1. KREMER, F.S.; PINTO, L.S. Plataformas de Sequenciamento de Nova Geração & Pré-processamento de dados. Laboratório de Bioinformática e Proteômica, Centro de Desenvolvimento Tecnológico, Universidade Federal de Pelotas. 2016. Disponível em: <http://labbioinfo.ufpel.edu.br/aulas_2016/Capitulo%203.pdf>
  2. SANTOS. W.F.; OLIVEIRA. M.S et al. Sequenciamento de DNA: Métodos e Aplicações. XIII Safety. Health and Environment World Congress. 2013. Disponível em: <https://copec.eu/congresses/shewc2013/proc/works/33.pdf>
  3. MOREIRA, L.M. Ciências Genômicas: Fundamentos e Aplicações. Sociedade Brasileira de Genética, Ribeirão Preto, 2015. ISBN 978-85-89265-22-5
  4. CARVALHO, M.C.C.G.; Silva, D.C.G. Sequenciamento de DNA de nova geração e suas aplicações na genômica de plantas. Revista de Ciência Rural. Santa Maria. 2010.
  5. Disponível em: <https://repositorio.unesp.br/bitstream/handle/11449/29442/S0103-84782010000300040.pdf?sequence=1&isAllowed=y>
  6. MOROZOVA, O.; MARRA, M. A. Applications of next-generation sequencing technologies in functional genomics. Genomics. 2008. DOI: 10.1016/j.ygeno.2008.07.001
  7. HUI, P. Next Generation Sequencing: Chemistry, Technology and Applications. Springer-Verlag. Berlin Heidelberg. 2012. DOI: 10.1007/128_2012_329.
  8. GODONE, R.L.N. Identificação de marcadores moleculares para diagnostico, predição e prognostico de câncer de mama. Universidade Federal do Pernambuco. 2018. Disponível em: <https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/32876>.
  9. OLIVEIRA, T.G.M. Aplicação de sequenciamento de nova geração no diagnostico molecular de cardiomiopatia hipertrófica. Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo. São Paulo. 2015. DOI: 10.11606/D.5.2015.tde-29102015-115502.
  10. RIBEIRO. I.H. Identificação das variants dos genes RHD e RHCE em pacientes com doença falciforme usando estratégia de sequenciamento de nova geração. Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo. São Paulo. 2020. DOI: https://doi.org/10.11606/D.5.2020.tde-23082021-103036.
  11. SHANG, F.; GUIHEN, E.; GLENNON, J.D. Recent advances in miniaturization. The role of microchip electrophoresis in clinical analysis. Electrophoresis. 2012. DOI: https://doi.org/10.1002/elps.201300359.
  12. COSTA. C.N. O uso de ferramenta de data analytics para o desenvolvimento de metodologia visando o mapeamento genético de doenças raras – Estudo de caso no rastreio do gene causador da cistinose. Universidade Federal Fluminense – UFF. Rio de Janeiro. 2020. Disponível em: https://app.uff.br/riuff/handle/1/16381.
  13. TURCHETTO-ZOLET. A.C.; TURCHETTO. C.; ZANELLA, C.M. Passaia, G. Marcadores Moleculares na Era genômica: Metodologias e Aplicações. Sociedade Brasileira de Genética. Ribeirão Preto, 2017. Disponível em: < https://www.lume.ufrgs.br/bitstream/handle/10183/206113/001056154.pdf?sequence=1>

How to Cite

Silva, R. C. ., Lima, A., & Souza , L. C. da S. (2022). Main methods of DNA sequencing. Scientific Electronic Archives, 15(10). https://doi.org/10.36560/15820221603